L'origine du citron est restée longtemps incertaine jusqu'en 2016 où il a été prouvé que le citron est issu du croisement entre la bigarade, une orange amère, avec le cédrat qui n'est aujourd'hui en France plus cultivé qu'en Corse.
Au moyen-âge, le citron était essentiellement utilisé comme acidifiant dans la cuisine.